فرآیند چاپی که معمولاً برای جعبه‌های مقوایی موج‌دار استفاده می‌شود، چاپ فلکسوگرافی است.

این روش چاپ از جوهر پایه آب برای چاپ مستقیم روی مقوای موج‌دار استفاده می‌کند و دارای ویژگی‌های زیر است:

1. می‌توان آن را برای تولید، از جمله چاپ، شکاف‌بندی، چین‌دار کردن، جعبه‌سازی، بسته‌بندی و سایر فرآیندها، پیوند داد.

۲. پیش‌نویس خط متن به راحتی تهیه می‌شود و برای چاپ متن و گرافیک‌های ساده مناسب است.

۳. پایداری کیفیت چاپ بالا نیست و کنترل عمق رنگ جوهر دشوار است.

۴. تأثیر کمی بر استحکام مقوای موج‌دار دارد و برای چاپ با فشار کم مناسب است.

۵. قیمت پایین، نسخه انعطاف‌پذیر با مقاومت چاپ بالا، قابل استفاده مجدد و قیمت جوهر نسبتاً پایین.

علاوه بر این، اگرچه چاپ افست و چاپ سیلک اسکرین نیز روش‌های اختیاری هستند، اما چاپ فلکسوگرافی به دلیل راندمان بالا، مقرون به صرفه بودن و مناسب بودن برای مقوای موج‌دار، به انتخاب اصلی برای چاپ جعبه‌های موج‌دار تبدیل شده است.

جعبه‌های کارتنی در تصاویر زیر با چاپ افست چاپ شده‌اند که مسلماً با چاپ جوهر آب متفاوت است.